دکتر اِگمن برای نقشه های شیطانی خودش رئیس جمهور و دخترش رو گروگان میگیره. برای نجات اون ها و همچنین نجات دنیا، سونیک باید به سرزمین اِگمن لند بره و ژنراتور اصلی رو خاموش کنه...اما اون نمیدونه که همه این ها یه تله است تا رباتی به اسم مگا متال سونیک رو فعال کنه. روباتی که هدفی جز کشتن سونیک براش تعریف نشده