دنیا به دو قسمت تقسیم میشه: دنیای دور و دنیای نزدیک. دنیای نزدیک جاییه که انسان ها توش زندگی میکنن و دنیای دور محل زندگی ایزدها و آیاکاشی ها-ذرات احساسی که قدرت مسخ کردن انسان ها رو دارن- هست. وظیفه ایزدها اینه که همکاری سلاح هایی به اسم شینکی که از روح انسان های مرده درست میشن، آیاکاشی ها رو از بین ببرن و جلوی مسخ شدن انسان ها رو بگیرن
یاتو، یک ایزد جنگه که رتبه پایینی داره. اون تصمیم میگیره برای خودش معبد داشته باشه برای همین یه سرویس اجابت دعای سیار راه میندازه و با 5 ین دعا و درخواست مردم رو اجابت میکنه. اما بعد از استعفای شینکی اون به اسم تومونه به خاک سیاه میشینه و موقتا فقط درخواست هایی رو اجابت میکنه که به آیاکاشی مربوط نباشن.
موقع گشتن دنبال یه بچه گربه، یه اتوبوس نزدیک بوده اونو زیر کنه اما دختری به اسم هیوری اونو نجات میده. به خاطر این کار، هیوری موقتا میمیره ولی زنده میشه. اما این اتفاق باعث بی ثباتی روح هیوری میشه و هر چند وقت یه بار روحش از بدنش بیرون میزنه. هیوری با پیشکش کردن 5 ین به یاتو، ازش میخواد بدنش رو درست کنه. اما یاتو بدون شینکی عملا به هیچ دردی نمیخوره. بنابراین هیوری اونو دنبال میکنه تا شاید یه شینکی گیرش بیاد و بدنش به حالت عادی برگرده. اما زیر صورت معصوم و خیرخواه یاتو، گذشته پیچیده ای مخفی شده...