یک روز یکی از رهبران کراس دیجیمون (دی کراس لیدر) از طریق شوتمون با تایکی، پسر خوش قلب 12 ساله، ارتباط برقرار میکنه و از اون کمک میخواد.
دی کراس لیدر یکی از ابزار هایی به شمار میره که از طریق فرآیندی به اسم "دیجیکراس" میشه با اون به دیجیمون ها نیرو انتقال داد.

تایکی رو به عنوان یکی از کاربران "جنرال" قبول میکنن و نتیجه اینه که تایکی و دوستاش به دنیای موازی دیجیمون ها می افتن.
دنیای دیجیمون در وظعیت بحرانی بدی به سر میبره و به خاطر شورش و حمله دیجیمون ها به هم توی وضعیت "کراس وارز" (جنگ صلیبی) به سر میبره و همه مثل دوران های قدیمی به هم دارن حمله میکنن.
تاکی، دوستاش و شوتمون، با ارتش دیجیمون متحد میشن و سعی می کنن با استفاده از دی کراس لیدر و فرآیند دیجی کراس، با دشمن ها مبارزه کنن